李江

李江

收藏

曾任华大基因科技服务中级信息分析工程师,长期从事转录组领域研究,熟悉生物信息分析常用数据库和软件,此外,参与骆驼等8个基因组项目项目研究。以共同作者身份在Nature Communications、PNAS、Giga Science、BMC Genomics和Frontiers in Plant Science等学术期刊发表文献近10篇。

该专家暂未发布文章。
暂未创建相册。
教育经历

2011.07毕业 南方医科大学 / 本科 专业:生物信息学

发表文章

Frontiers in Plant Science

论文名称:An improved fruit transcriptome and the identification of the candidate genes involved in fruit abscission induced by carbohydrate stress in litchi

贡献描述:负责全部信息分析以及设计分析方案

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AME

论文名称:The draft genome of Tibetan hulless barley reveals adaptive patterns to the high stressful Tibetan Plateau.

贡献描述:转录组分析以及抗旱基因挖掘,相关图表制作。

GigaScience

论文名称:A reference gene set construction using RNA-seq of multiple tissues of Chinese Giant Salamander, Andrias davidianus

贡献描述:设计分析思路,负责全部信息分析,相关图表制作

Nature communications

论文名称:Camelid genomes reveal evolution and adaptation to desert environments.

贡献描述:负责分析转录组部分内容,主要包括基因表达量计算、差异分析、及富集分析及可变剪切、SNP等分析。此外,还进行转录组denovo分析,WGCNA分析,以及为客户提供技术支持。

Nature communications

论文名称:Gekko japonicus genome reveals evolution of adhesive toe pads and tail regeneration

贡献描述:标准分析:基因表达分析、差异分析和差异基因富集分析。 个性化分析:再生基因的挖掘,再生相关基因表达pattern分析和相关图表的绘制。

Frontiers in Plant Science

论文名称:An improved fruit transcriptome and the identification of the candidate genes involved in fruit abscission induced by carbohydrate stress in litchi

贡献描述:查阅文献,确定分析思路,负责信息分析。

GigaScience

论文名称:Draft genomes of two blister beetles (genus: Hycleus) harvested for the potent blistering agent cantharidin

贡献描述:设计并完成信息分析方案

工作经历

2011.07——2016.08 华大基因

职位名称:中级信息分析工程师

工作简介:主要从事转录组方向工作,如转录组组装、基因功能注释、表达计算以及差异分析等工作,熟悉生物信息分析常用数据库和软件。大项目经验方面,曾参与骆驼等8个基因组项目研究,主持大鲵转录组分析。曾担任BGI交付中心RNA方向负责人,新员工技术导师2次。

项目经验

2013.01——2015.06 壁虎基因组项目

项目类型:动植物基因组denovo测序

项目经验简介:为了解壁虎的适应性进化和生物特性,对壁虎进行了基因组测序和分析,从多个方面研究了壁虎的生物学特性,为爬行动物及其适应性进化相关研究提供了宝贵的资源,同时对于断肢再生和再生医学的相关研究也有重要意义。

2013.06——2014.02 骆驼基因组项目

项目类型:动植物基因组denovo测序

项目经验简介:本项目分别对一头双峰驼,一头单峰驼和一头羊驼提取血液DNA进行了高深度全基因组从头(de novo)测序,并同时结合双峰驼的转录组数据,研究骆驼的沙漠适应性以及骆驼科物种的进化历程。通过比较基因组学研究,揭示了骆驼科物种在脂肪代谢、水代谢,热应激,耐干旱,抗紫外辐射,应对沙尘暴的方面的特性。转录组分析揭示了骆驼特殊的渗透调节与渗透保护,与水分保持机制。

2012.08——2014.09 青稞基因组项目

项目类型:动植物基因组denovo测序

项目经验简介:利用基因组鸟枪法,对青稞地方品种“拉萨钩芒”进行了深度测序,发现青稞基因组大小为4.5Gb左右,其中80%以上为重复序列。组装获得约3.89Gb基因组序列,占整个基因组的87%。共预测出36,151编码蛋白基因,并将其中近94%的基因锚定到了7条染色体上。

2012.10——2015.06 荔枝转录组项目

项目类型:真核转录组测序

项目经验简介:利用转录组测序,研究荔枝果实发育的基因表达。

2015.01——2016.10 利用转录组测序构建大鲵基因集

项目类型:真核转录组测序

项目经验简介:大鲵的基因组很大,采用常规的DNA测序并不能有效构建大鲵的参考序列。利用大鲵的24个组织部位的转录组数据,开发一套行之有效的基因集构建方法。

2016.06——2018.02 利用DNA低深度构建复杂物种基因集

项目类型:动植物基因组denovo测序

项目经验简介:利用DNA低深度测序构建复杂物种基因集,评估基因集完整度,并构建物种进化树,成果发表在GigaScience上。

荣誉证书

2013.12 2013年度华大基因科技服务有限公司卓越员工奖

李江
让专家为我设计方案 客服在线,来聊聊吧