周宝津

周宝津

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本人自2010年以来专注在质谱技术的研发与应用,经验丰富,发表文章数十篇,在基因帮平台接手项目数十个,对人体医学和水稻有较深入的研究。欢迎来基因帮找我做项目,特别是蛋白相关的项目。

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教育经历

2014.07毕业 香港中文大学 / 硕士 专业:生物信息学

2010.07毕业 华南农业大学 / 本科 专业:生物技术

发表文章

SCIENCE

论文名称:Deep functional analysis of synII, a 770-kilobase synthetic yeast chromosome

贡献描述:完成蛋白组、代谢组部分实验和数据分析

ANALYTICAL CHEMISTRY

论文名称:Expansion of the Ion Library for Mining SWATH-MS Data through Fractionation Proteomics

贡献描述:完成DIA数据实验、信息分析部分

PLoS One

论文名称:Stress Responsive Proteins Are Actively Regulated during Rice (Oryza sativa) Embryogenesis as Indicated by Quantitative Proteomics Analysis

贡献描述:本项目主要贡献在构建目标蛋白MRM方法,进行质谱检测,后续分析MRM数据,对iTRAQ蛋白定量值的验证

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

论文名称:Quantitative Analysis of the Human AKR Family Members in Cancer Cell Lines Using the mTRAQ/MRM Approach

贡献描述:完成实验部分,信息部分

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

论文名称:Biomarker discovery and verification of esophageal squamous cell carcinoma using integration of SWATH/MRM

贡献描述:完成实验采集、数据分析指导

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

论文名称:Appraisal of the Missing Proteins Based on the mRNAs Bound to Ribosomes

贡献描述:参与生物信息分析

Epigenetics

论文名称:Integrated detection of both 5-mC and 5-hmC by high-throughput tag sequencing technology highlights methylation reprogramming of bivalent genes during cellular differentiation

贡献描述:利用质谱仪QTRAP5500对10中脱氧核苷酸、甲基化脱氧核苷的定量分析,已验证甲基化基因组学的发现

GENOME BIOLOGY

论文名称:Integrated analyses of DNA methylation and hydroxymethylation reveal tumor suppressive roles of ECM1, ATF5, and EOMES in human hepatocellular carcinoma

贡献描述:利用质谱仪QTRAP5500对10中脱氧核苷酸、甲基化脱氧核苷的定量分析,已验证甲基化基因组学的发现

工作经历

2010.03——2017.05 华大基因研究院

职位名称:蛋白组、代谢组交付组主管

工作简介:从事质谱相关应用工作,包括蛋白组和代谢组学研究。

项目经验

2015.03——2017.03 酵母合成基因组

项目类型:

项目经验简介:

2013.01——2014.06 DIA新型数据处理策略

项目类型:

项目经验简介:该研究主要是利用分组分的DDA数据建库,并利用全局保留时间归一化进行肽段保留时间校正,来探索该策略对DIA数据的提取效果。项目发现,该方法提升效果明显,也证实了DIA数据与iTRAQ数据、Label-free数据相关性好。为推广DIA在科研上的广泛利用提供有力证据

2011.07——2013.09 水稻发育蛋白组

项目类型:

项目经验简介:利用iTRAQ和MRM蛋白组技术探索水稻发育工程中的分子变化。

2011.01——2013.04 醛酮还原酶在癌症细胞的表达谱

项目类型:

项目经验简介:本项目利用MRM策略进行7种癌细胞醛酮还原酶家族蛋白的绝对定量。本文利用mTRAQ新型技术,提高了定量的准确性,降低了传统稳定同位素肽段策略的成本、周期。

2014.07——2015.07 DIA定量蛋白组学在食管癌biomarker上的应用

项目类型:

项目经验简介:本研究结合利用DIA的定量蛋白组学和MRM靶向蛋白组技术进行食管癌组织biomarker的筛查。

2012.07——2015.07 CHPP人类染色体蛋白组计划

项目类型:

项目经验简介:参与人类染色体蛋白组计划工作

2012.07——2014.07 利用靶向代谢组学验证基因甲基化

项目类型:

项目经验简介:

荣誉证书

2017.01 华大基因学院中级讲师

周宝津
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