张梦华

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武汉爱基百客生物科技有限公司主营ChIP-seq,技术人员从事ChIP实验长达5年以上,处理的样本类型多样:植物、动物、真菌、细胞、微生物,拥有微量建库技术(1ng)及专业的生信分析团队(可个性化分析,有专业的云分析网站,可在线查看分析项目,原图直接下载,条理清晰,专业分析人员解读报告),项目经验丰富。

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教育经历

2017.06毕业 湖北第二师范学院 / 本科 专业:生物工程

项目经验

2017.05——2017.07 水稻样本chip-seq技术服务

项目类型:

项目经验简介:水稻ChIP富集、建库、测序、分析。RNA-seq与ChIP-seq联合分析等。 主要分析内容如下: 1.数据过滤 a. Raw Data数据质量评估 b. Clean data数据质量评估 c. 测序数据质量评估 2.基因组比对 a. 比对结果统计 3.Peak分析 a.Peak最近TSS基因列表 b.Peak富集区间基本信息 c. Peak在基因组分布 d. Peak在基因组各区域的分布比例 e.Peak最近TSS基因的GO注释 f. Peak最近TSS基因的KEGG注释 4.Motif分析 a.Peak区域motif预测 5.RNA-seq与ChIP-seq联合分析

2017.11——2017.12 香草兰RNA-seq

项目类型:

项目经验简介:1、对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads的处理 2、测序评估(包括:数据比对统计、测序质量评估、测序饱和度分析、测序随机性的统计分析、Reads 在参考基因/基因组上的分布分析)) 3、de novo 序列组装 4、基因表达注释(包括:基因覆盖度统计、结果文件列表、结果文件示例) 5、差异表达基因分析 6、组间差异表达基因分析 7、差异基因表达模式聚类分析 8、GO功能显著性富集分析 9、GO功能分类分析(WEGO分析) 10、Pathway 显著性富集分析 11、蛋白互作网络分析(目前只有人和小鼠能够做此项分析,参考基因组序列来源于NCBI) 12、转录因子分析 13、主成分分析(PCA) 14、SNP/InDel分析 15、SSR引物标记开发 16、新转录本预测分析 17、可变剪切分析

张梦华
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